clock.nc.fukuoka-u.ac.jp は良く例として提示されていますが、混雑気味なので他を利用しましょう。
個人的にお勧めはhttp://www.jst.mfeed.ad.jp/です。
ntpサーバの構築はこちら
強制的に指定の時刻に合わせる場合 †
2017年10月17日 23時00分に合わせる場合
# date -s "10/17 23:00 2017"
VirtualBoxでサーバを立ち上げている場合はホストOSと時刻を同期する機能が働くようです。
この機能を停止する方法はVirtualBoxとVagrantで開発環境構築に書いておきます。
手動で指定のntpサーバに合わせる場合 †
# /usr/sbin/ntpdate -b ntp.jst.mfeed.ad.jp
ハードウェアクロックもシステムクロックに合わせておく
# /sbin/hwclock --systohc
定期的に合わせる場合 †
# crontab -e
毎時0分に実行
0 * * * * /usr/sbin/ntpdate -b ntp.jst.mfeed.ad.jp > /dev/null 2>&1
タイムゾーンを日本に変更 †
/etc/localtime を上書きします
# cp /usr/share/zoneinfo/Japan /etc/localtime
NTPリフレクション攻撃を防ぐ †
monlist機能を悪用してDDoS攻撃の踏み台にされるおそれがあります。
restrictを追加して防ぐ方法もありますが、面倒そうなので、monlist機能自体を停止しちゃいましょう。
/etc/ntp.conf に次の1行を追加
disable monitor
参考：ntpd の monlist 機能を使った DDoS 攻撃に関する注意喚起
