EC-CUBEの定数定義については以下のファイルで行われています。
app/config/eccube/packages/eccube.yaml
こちらに追記しても良さそうですが、アップデート時に上書きされてしまうという噂もあります。
なので別ファイルに定義します。
app/config/eccube/packages/customize.yaml
parameters: eccube_customize_parameter: 1
Controllerでは以下で取得できます。
dump($this->eccubeConfig['eccube_customize_parameter']);