強引に使用しようとすると「$」の扱いで競合しているようで、商品のソートなどができなくなりました。
<script src="//ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.2.1/jquery.min.js"></script> <script> $(function(){ alert('Hello World'); }); </script>
Magento側でjQueryが使用できるようになっているようなので、以下のように記述することで競合が解決できました。
<script> require(['jquery'], function(jQuery){ jQuery(function(){ alert('Hello World'); }); }; </script>